2016年10月28日，經國家批準，自治區正式下發了《關於印發2016年新疆維吾爾自治區棉花目標價格改革試點工作實施方案的通知》。2016年是新疆棉花目標價格補貼細則實施的第三年，棉價在經過了連續兩年的低迷之後，終於在今年4月份迎來強勢反彈，無論期貨還是現貨價格都出現了飆升的情況。在市場價格走高的同時，新疆棉花目標補貼價格連續走低，由2014年的19800元/噸降至2016年的18600元/噸。這一增一減帶來的結果無疑會減少國家補貼額度，相比前兩年，2016年棉農植棉總收益是否會下降呢？
　　
　　據悉2014年新疆地方棉花補貼按“60%麵積+40%產量”的方式核算，其中麵積每畝補貼267.63元，產量補貼0.688元/公斤。據相關機構測算，2014年新疆棉農平均每畝獲得補貼額是444.39元。如果扣除植棉總成本，棉農收支基本持平，甚至略有盈利。
　　
　　2015年，據新疆自治區發改委價格成本監審局統計，2015年新疆棉花畝均成本2119.55元，其中生產成本1747.84元，土地成本371.39元。2015年新疆棉花90%按照產量方式補貼，其餘10%給予南疆四地州(和田、阿克蘇、喀什、克州)麵積補貼。2015年度新疆籽棉收購價格基本在5.3-5.8元/公斤，補貼下發後棉農售棉價相當於7.29-7.79元/公斤。根據測算，2015年由於棉花生產形勢不景氣，如果是在自有土地上種棉的話，加上補貼(暫按平均500元/畝計算)，棉農應該有超過200元/畝的收益。
　　
　　2016年新疆地方仍舊90%按照產量方式補貼，10%按照麵積方式補貼(僅限南疆四地州)。2016年棉花目標價格為每噸18600元，比2015年每噸減少500元，按照畝產籽棉300公斤推算，2016年目標價格補貼下發後預計棉農籽棉平均交售價格在7.44元/公斤，與2015年相比上下浮動範圍在0.2元/公斤左右，並未對棉農收益產生重要影響。
　　
　　由此看來，盡管今年目標價補貼額度有所降低，但對棉農收益並未產生多大影響。新疆棉花目標價格對保障棉農植棉收益，穩定新疆棉花種植麵積起到了積極作用。